تأسس المتحف الإستوني الوطني في تارتو عام 1909 بمبادرة وبدعم من الأمة بهدف حماية وتطوير تاريخ وثقافة إستونيا. كما هو الحال في العديد من البلدان الأوروبية الأخرى، تم إيلاء أهمية أساسية للحفاظ على ثقافة الفلاحين القديمة المتلاشية، كما تم اعتبار جمع القطع الأثرية والعناية بها أمرًا ضروريًا، مما يسهم في فهم أفضل للتنمية الثقافية والاكتشافات الأثرية والعملات القديمة والكتب والمخطوطات والسجلات التاريخية.