جزيرة بوناكن هي واحدة من المزارات الطبيعية التي تجذب عدداً لا بأس به من السياح كل عام، وذلك لما تتمتّع به من جمال يخطف الأنظار، فهي ذات مياه فيروزية برّاقة وصافية جداً وأجواء منعشة وشعاب مرجانية لا مثيل لها وثروة بحرية مُبهرة تعيش في الحديقة البحرية الوطنية التي تحمل الاسم ذاته، مما يجعلها من أفضل الوجهات لممارسة الغوص والغطس خاصة في الفترة الواقعة بين شهريّ ابريل ونوفمبر.