يتميز مسجد الجزار بهندسته المعمارية الجميلة على الطراز المعماري الإسلامي، فالمبنى تحفة فنية جميلة إذ تنتشر النقوشات والأيات القرآنية على جدرانه، هذا الى جانب الرخام الأبيض البارز الموجود فوق النوافذ. كما أن البناء قوي جدا وصمد ضد عوامل الزمن طوال هذا الوقت نظرا لبنائه باستخدام حجر الغلق الذي استخدم لاقفال الأقواس من الأعلى ما جعلها أكثر صلابة، ويوجد في الرواق الشرقي للمسجد سبع نوافذ مزخرفة مكسوة بالرخام، ويتميز المسجد بشكل خاص بقبته كروية الشكل التي يبلغ قطرها عشرة أمتار والتي تكسوها ألواح الرصاص من الخارج. ومن الجدير بالذكر أن المسجد يتمتع بمكانة دينية خاصة لدى المسلمين لذا يزوروه بشكل دائم.