يختص المتحف التاريخي الفلبيني الياباني بعرض مجموعة كبيرة ومتنوّعة من القطع الأثرية التي يعود تاريخها إلى فترات مختلفة من تاريخ مدينة دافاو، بما في ذلك أقدم الحسابات والسجلات التاريخية للمستوطنين اليابانيين الذين أتوا للعمل في مزارع الأباكا المجلية، والمقتنيات التي تروي أحداث ما قبل وبعد الحرب العالمية الثانية كالأدوات القديمة والعملات المعدنية والفواتير وغيرها.